在防治畜禽流行症中，合理运用消毒药是很主要的，针对分歧的消毒物体，应选择幻想的消毒药物。幻想的消毒药应是杀菌功能好，效果敏捷，对人畜无损害，性质不变，可溶于水，无易燃性和爆炸性，价钱低价。然则，现有的消毒药都存在必然的缺陷，还没有—种消毒药是完全幻想的。也就是说，还没有一种消毒药在任何前提下可以杀死一切的病原微生物。
　　消毒药的效果受很多要素的影响而加强或削弱。在实践任务中，为了充沛发扬消毒药的效能，对这些要素应该很好地调查和使用。
　　微生物的敏理性分歧的病原微生物，抵消毒药的敏理性有很分明的分歧。例如病毒对碱和甲醛很敏感，而对酚类的抵当力却很大。大大都的消毒药对细菌有效果，但对细菌的芽孢和病毒效果很小。因而，在消毒时应依据病原的特点选用消毒药。
　　情况中有机物质的影响当情况中存在很多的有机物如畜禽的粪、尿、血、炎性渗出物等时，能障碍消毒药直接与病原微生物接触，而影响消毒药效能的发扬。因为这些有机物往往能中和、吸附局部药物，也使消毒效果削弱。因而，在消毒药物运用前，应进行充沛的机械性打扫，肃清消毒物品外表的有机物，使消毒药能充沛发扬效果。
　　消毒药的浓度普通说来，消毒药的浓度愈高，杀菌力也就越强，但跟着药物浓度的增高，对活组织的毒性也就响应地增大了。当浓度到达—定水平后，消毒药的效能就不再增高。因而，在运用中应选择有用和平安的杀菌浓度。例如70％的酒精杀菌结果要比95％的酒精好。
　　消毒药的温度消毒药的杀菌力与温度成正比，温度增高，杀菌力加强，因此夏日消毒效果比冬天要强。
　　药物效果的工夫普通状况下，消毒药的效能与效果工夫成正比，与病原微生物接触的工夫越长，其消毒结果就越好。效果工夫若太短，往往达不到消毒的目标。